内蒙古的河流分属于外流和内流两大水系。大兴安岭、阴山和贺兰山是内外流水系的主要分水岭。外流水系主要由黄河、永定河、滦河、西辽河、嫩江与额尔古纳河等6个水系组成，流域面积61.37万平方公里，占全区总面积的52.5﹪，主要汇入鄂霍次克海和渤海。内流河水系分布比较零星，主要河流有乌拉盖河、昌都河、塔布河、艾不盖河、额济纳河等，流域面积11.66万平方公里，占全区总面积的9.9﹪，无流区分布于深居内陆的荒漠地区，面积43.94万平方公里，占全区面积的37.5﹪。大部分河流流向为西北一东南向，呈平行排列，其间距由东向西越来越大，河网结构类型分为树枝状、扇状、羽状、格状、线状等。主要河流皆发源于大兴安岭和阴山山地两侧，降雨、地下水和融雪水是各河流水量补给来源，以降雨补给为主。每年7—8月是一些河流的洪水期。也有融冰、融雪水形成的春汛。春季黄河在内蒙古段出现凌汛。不少河流在冬季和春季有枯水现象。河流的径流年内分配极不均匀，含沙量普遍较高，鄂尔多斯东侧的纳林河是全区含沙量最大的河流。湖泊星罗棋布，有1000余个，主要分布于西辽河平原、内蒙古高原、鄂尔多斯高原。可分为咸水湖、微咸湖和淡水湖。水面面积大于100平方公里的天然湖泊有呼伦湖（达赉湖）、贝尔湖、达里诺尔、乌梁素海、岱海、黄旗海、查干诺尔、居延海。地表水储量675亿立方米，除黄河过境水235亿立方米外，境内自产水资源440亿立方米。

额尔古纳河  在黑龙江南源，位于内蒙古东北部。上源称海拉尔河，发源于大兴安岭西侧的吉鲁契那山，西流至新巴尔虎左旗西北部，称额尔古纳河。折向东北在额尔古纳右旗北端的思和哈达镇附近，与俄罗斯境内的石勒喀河汇合为黑龙江，全长1608公里，自治区内干流长540公里，流域面积11.6万平方公里，水量116亿立方米。河水含沙量小，其干流是中俄两国界河，主要支流有伊敏河、根河、得耳布尔河、莫尔道嘎河、阿巴嘎河、激流河、乌马达河、大司洛夫卡河等。呼伦贝尔市西部的主要河流湖泊均属额尔古纳河水系。

海拉尔河  又名海勒、海兰尔、哈拉尔等。系额尔古纳河的上游名称。位于呼伦贝尔市的西南部，自东而西纵贯呼伦贝尔高原的中部。发源于大兴安岭西麓吉鲁契那山，海拔1300余米，干流长708公里，流域面积5.43万平方公里。河网集中于东部，是该流域主要干流区。主要支流有库里多尔河、牧羊河、莫尔格勒河、免渡河、伊敏河等。大部支流发源于大兴安岭西坡的林区，形成一个扇状水系，河水清澈，与呼伦湖相通。

根河  额尔古纳河支流。发源于大兴安岭伊吉奇山的西南，东北—西南流向，在呼伦贝尔市额尔古纳旗四卡附近注入额尔古纳河，河长461公里，主要支流有伊图里河、依根河、上库勒河等。

激流河  额尔古纳河支流。发源于大兴安岭西麓的三望山，河长449公里，在呼伦贝尔市额尔古纳右旗田登科附近注入额尔古纳河，主要流经地区有额尔古纳左旗和右旗。有阿龙山河等支流。

伊敏河  海拉尔河支流。发源于大兴安岭西南麓，自南向北流经呼伦贝尔市鄂温克族自治旗，穿过海拉尔市区北入海拉尔河，河长359公里。其主要支流有辉河、锡尼河、威特根高勒、敖宁高勒、咸纳罕高勒、牙多日高勒等。

莫尔格勒河  海拉尔河支流。发源于大兴安岭西麓，沿陈巴尔虎山地由东北；流向西南，在滨州（哈尔滨至满洲里）铁路线上的乌固诺尔车站附近注入呼和诺尔，流入海拉尔河。河长290公里，河道“九曲回肠”，被誉为“天下第一曲水”。主要流经呼伦贝尔市的陈巴尔虎旗。

哈拉哈河  发源于大兴安岭南麓吉里革先山南坡五道沟附近。呼伦贝尔市境内流域面积7520平方公里。干流呈东南—西北流向。主要支流有两支，一支直接注入乌尔逊河，一支通过贝尔湖注入乌尔逊河。

乌尔逊河  发源于贝尔湖北岸，北流注入呼伦湖，长233公里。上游为额尔古纳河水系的哈拉哈河，位于呼伦贝尔市新巴尔虎右旗和新巴尔虎左旗交界处。河流两岸地形平坦，河宽60～70米，河漫滩上苇柳丛丛，湿地较多，河两岸畜牧业发达。

克鲁伦河  发源于蒙古国肯特山东麓。在中游乌兰恩格尔西端进入中国境内。流经呼伦贝尔市新巴尔虎右旗，东流注入呼伦湖，全长1264公里，在中国境内206公里。流域面积715万平方公里，两岸为半荒漠的低山围绕，地表径流不发育。两岸沼泽湿地多，较高的阶地上生长着优良牧草，牧业发达。

嫩江  在松花江平原。内蒙古东部最大河流。发源于大兴安岭支脉伊勒呼里山南坡，南北纵贯呼伦贝尔市东部，经过黑龙江省嫩江市、齐齐哈尔市，在黑龙江、吉林两省边境入松花江。海拔1044米，全长1369公里，流域面积24.39万平方公里，其中在内蒙古境内的流域面积为15.91万平方公里。主要支流有甘河、那都里河、多布库尔河、欧肯河、诺敏河、阿伦河、雅鲁河、绰尔河等河流，自西北向东南汇入嫩江。

甘河  嫩江支流。发源于大兴安岭东侧沃其山麓，海拔1197米，两岸牧业发达。干流流向西北一东南，主要流经呼伦贝尔市莫力达瓦达斡尔族自治旗、鄂伦春自治旗，河长446公里，流域面积1.95万平方公里，在黑龙江省嫩江市附近汇入嫩江。主要支流有阿里河、奎勒河。

诺敏河  嫩江支流。发源于大兴安岭支脉伊勒呼里山南麓，河长467公里。在呼伦贝尔市莫力达瓦达斡尔族自治旗尼尔基镇附近分两支岔注入嫩江，流域面积2.6万平方公里，主要支流有毕拉河和格尼河。

阿伦河  嫩江支流。发源于大兴安岭博克图腰梁子附近。海拔1202米，河长318公里，流域面积6757平方公里。流域形状为窄长方形，具有河流短和分布均匀的特点，主要流经呼伦贝尔市阿荣旗境内，成吉思汗边堡以下属黑龙江省。

雅鲁河  嫩江支流。发源于大兴安岭博克图附近，海拔1266米，河长398公里，主要流经呼伦贝尔市牙克石市和扎兰屯市，在黑龙江省龙江县东入嫩江。流域面积2.06万平方公里，其中内蒙古境内1.46万平方公里，有济沁河、罕达罕河、阿木牛河、卧牛河等主要支流，下游经常移动，遗有很多河道、牛轭湖和沼泽地，并有砂砾层分布。

绰尔河  嫩江支流。发源于大兴安岭顶无名山，海拔1369米。河长470公里，流域面积1.72万平方公里，主要流经呼伦贝尔市的牙克石市、扎兰屯市和兴安盟的扎赉特旗，东南流到与黑龙江省交界处注入嫩江。河谷窄深，两岸支流密布且分布均匀。

洮儿河  兴安盟主要河流之一，属嫩江水系。发源于大兴安岭东麓索岳尔格山和老山头，流经兴安盟科尔沁右翼前旗和乌兰浩特市，东南流到吉林省大安、镇赉两县交界处的月亮泡注入嫩江。全长595公里，年平均流量每秒26立方米，河道较平缓，汛期夹带大量泥沙。河畔植被茂密，河内有珍贵的水獭和鲤鱼等水产资源。

归流河  归流河系蒙古语，意为山杏，属嫩江水系，洮儿河支流。发源于大兴安岭西麓宝格达山，全长218公里，流域面积9706平方公里，在兴安盟乌兰浩特市境内汇入洮儿河，年平均流量为每秒13立方米。

霍林河  属嫩江水系。发源于通辽市的扎鲁特旗格罕山西麓，流经霍林郭勒市、兴安盟科尔沁右翼中旗等地，流入吉林省洮南市。干流全长590公里，流域面积为27840平方公里。主要支流有解生吐河、坤都冷河、东哲里木河、敦都乌苏河、巴彦哈拉河等5条常年河。

西辽河  辽河西源之一。上游北源西拉木伦河出赤峰市克什克腾旗西南，南源老哈河出河北省平泉县，流经河北省和内蒙古境内，在赤峰市和通辽市交界的苏家堡处汇合后称西辽河。干流长827公里，流域面积14.18万平方公里。

老哈河  西辽河南源，古称乌候秦水。发源于河北省平泉县西北山区柳西川，流经赤峰市东南部，在翁牛特旗与奈曼旗交界处，与西拉木伦河合流以下称西辽河。全长426公里，流域面积33076平方公里。主要支流有八里罕河、坤都冷河、英金河、羊肠子河等10条，均系长年流水河。流经敖汉旗、翁牛特旗接壤处，有奇特的响水瀑布。翁牛特旗境内东南河道上建有红山水库，是一座有防洪、灌溉、发电、养殖综合效能的大型水库。

西拉木伦河  蒙古语，意为黄色的河，西辽河北源。发源于大兴安岭山地赤峰市克什克腾旗红山北麓白槽沟。古称潢水、饶乐水、吐护真水等。全长380公里，流域面积32171平方公里，全河总落差1134米，通行舟楫河道800余里，属外流河，河水夹带黄沙，有查干沐沦河和乌力吉沐沦河等主要支流。

教来河  属西辽河水系，一级支流。发源于赤峰市敖汉旗金厂沟梁镇，流经克力代、贝子府、敖吉3个乡及下洼镇，横贯通辽市奈曼旗后汇入西辽河。平均河床宽约300米，常年流水，可灌溉两岸农田数十万亩。

新开河  属西辽河水系一级支流，系通辽市主要河流之一。流经地区有通辽市的科尔沁左翼中旗和开鲁县等，其北岸建有他拉干水库，河两岸为广阔的冲积平原，大部是肥沃的农田和平坦的草牧场。

乌力吉沐沦河  蒙古语意为吉祥的河，属西辽河水系，古称长狼河。发源于赤峰市巴林左旗北部乌兰达坝北侧的巴颜乌兰峰。汇集横河、乌兰达坝河、干支嘎河、浩尔吐郭勒河、沙里河等，经阿鲁科尔沁旗和通辽市扎鲁特旗，注入新开河。水质良好，总长度250公里。

滦河水系  古后濡水。发源于河北省丰宁县，由西向北流入沽源县，称闪电河。经锡林郭勒盟正蓝旗折向东，称上都河。入多伦县后，至查干敖包东黑风河汇合，始称滦河。经小菜园出境复入河北省丰宁县。较大支流有羊肠子河、黑风河、蛇皮河、吐鲁根河等，河道蜿蜒曲折。流域面积5889平方公里，水质清澈，盛产鱼类。

永定河水系  永定河北支大洋河和南支御河的上游部分。流域面积5606平方公里，大洋河发源于乌兰察布市兴和县，其主要支流有二道河（又称后河）、黄石崖河、银子河、银子川等。御河发源于乌兰察布市丰镇市，主要支流有饮马河、阳河、巴音图河等。均处于山地丘陵区，河道坡度大，谷深河窄，沟壑纵横，水土流失严重，河流含沙量大。

黄河  是流经内蒙古境内的最大河流。河套平原和土默川平原的主要灌溉水源，过境水235亿立方米。从宁夏回族自治区石嘴山进入内蒙古境内，流经河套平原和土默川平原，从鄂尔多斯准格尔旗榆树湾镇出境，区间干流长830公里，区内流域面积14.35万平方公里，最宽处4000米，最窄处200米。河道不稳定并逐步抬高，贺兰山麓的洪积扇高出黄河水面30～70米，易遭洪水灾害。巴彦淖尔市磴口县境内建有三盛公大型水利枢纽工程。在内蒙古地区的较大支流左岸有五当沟、水涧沟、美岱沟、万家沟、水磨沟、哈拉沁沟以及大黑河、浑河等；右岸有毛不浪沟、卜尔色太沟、黑赖沟、西柳沟、罕台沟、哈什拉川、母化河、虎尔斯内沟。以及都思图河、纳林河、乌兰木伦河等。这些河流的主要特点是河沟短，流域面积小，沟深坡陡，比降大，除洪水期外，平时水流量很少，甚至干涸，在内蒙古地段每年春季出现凌汛。

乌加河  位于内蒙古西部河套平原北部，又作五加河。原为黄河主流，后因流沙侵入和狼山山洪冲积,河床抬高淤断，主流南移。清朝末年后套灌溉河道开掘后，成为排水渠，余水在巴彦淖尔市乌拉特前旗西部储为乌梁素海，有小排水沟（王六子壕）同黄河相通，现已成为河套灌区的主排干渠。

昆都仑河  是包头市境内最大的黄河支流，成为大青山与乌拉山的天然分界，古称石门水。发源于固阳县，其上游俗称北齐沟，南北流向，流经包头市区，在哈林格尔乡注入黄河。全长143公里，有支流23条，流域面积2716平方公里,属季节性河流，山洪多发生于7—8月，历史洪峰7050立方米/秒（1856年），下游建有昆都仑水库。昆都仑沟河平坦，可行车马，是横穿阴山最理想的交通坦途。

无定河  黄河中游支流。因河水流量变化不定而得名。蒙古语称萨拉乌素高勒（黄水河），古称奢延水、朔方水，唐代始称无定河。发源于陕西省白于山北侧，向北绕经鄂尔多斯乌审旗南端，再折东南穿越长城经绥德县，到清涧县河口入黄河，全长375公里。自滴哨沟湾入乌审旗，流穿河南方北沿、纳林河乡中南部，由大草湾出界，在鄂尔多斯境内流长90公里，水深1米左右。上游巴图湾河段建有中型水库、水电站和渔场，沿河两岸为乌审旗主要产粮区。上游又叫红柳河。主要支流有纳林河、海流图河。

都思图河  都思图为蒙古语，意为似油的河，属于黄河支流，位于鄂尔多斯鄂托克旗西部，源于色日洁苏木海流图滩，全长156公里，宽50～100米，流域面积8300余平方公里，流域内水草丰美，树木繁多，是良好的牧场。

大黑河  黄河支流。北魏时称荒干水，隋唐时称金河，后以流域土质黝黑而称现名。南源乌兰察布市卓资县十八台乡，北源于卓资县白银厂汗乡和察哈尔右翼中旗小珠英太，在卓资县旗下营南侧两源合流，后流经呼和浩特市郊区、土默特左旗，在托克托县汇入黄河。全长219公里，在呼和浩特境内147公里。主要支流有大庙沟河、五贝滩河、石人湾河、小黑河等。最大洪峰2000立方米/秒，最小洪峰200立方米/秒，是呼和浩特市郊区、土默特左旗、托克托县的主要灌溉河流，可灌溉耕地50余万亩。

乌拉盖河  内蒙古最大的内流河之一。古称兀鲁骨、乌尔虎、芦河。发源于大兴安岭西侧的宝格达山，向西南流至胡稍庙，然后折东向西，至新庙以西，河槽逐渐消失，形成大片湿地和湖泊，最终注入乌珠穆沁盆地最低处索里诺尔大洼地。主要支流有舍野日机河、宝日斯太河、彦吉嘎河、高力罕河、巴拉盖尔河。主要流经锡林郭勒盟的东乌珠穆沁旗、西乌珠穆沁旗。

锡林郭勒河  锡林郭勒为蒙古语，意为高原上的河流，史称西林河，是锡林郭勒草原上的内流河。发源于赤峰市的克什克腾旗境内，纵贯锡林郭勒市中部，上游东西流向，处于丘陵地带，河谷宽1公里，形成河涧盆地，间有沼泽，最后注入东乌珠穆沁旗的白淖尔湖。

艾不盖河  乌兰察布草原上的内流河。发源于乌兰察布市达尔罕茂明安联合旗西南犒劳以根山地，向东流又折向北流，最终归入腾格尔诺尔，全长约205公里，上游区为山地，河谷宽2公里左右；中游流过丘陵与石山交错地带，河谷宽300～600米；下游流经一片戈壁，河床逐渐消失，河水潜没入诺尔之中。

塔布河  塔布系蒙古语，意为五，因为上游五水汇合而得名。内蒙古中部的内流河，发源于包头市固阳县东北部南沟村，然后北流入乌兰察布市的四子王旗境内，最终汇入呼和诺尔，干流全长316公里。上游段为山区，谷深40米左右，河槽宽约10～30米，中游段山地与丘陵相间分布，下游两岸多系台地,是干旱草原，河槽渐至不明显。

额济纳河  又称弱水。是内蒙古西部荒漠区中的最大河流，位于阿拉善盟额济纳旗境内。发源于青海省祁连山南麓，上游河源的黑河和临水在鼎新汇合后北流入内蒙古境内称额济纳河。河长250公里，无径流。呈南北走向，弯曲度小。向北流至狼心山分为东河（纳林高勒）和西河（穆林高勒）最终分别汇入东、西居延海（索果诺尔和嘎顺诺尔）。东河下游有昂茨河、古尔本汗立河、哈拉素海河、达西敖包河、纳林河5个支流，平水期河水主要经西敖包河入东居延海。西河分穆林高勒、赛汗高勒、乌兰艾立格高勒、克列图高勒和巴嘎高勒5个支流，以多口形式河水注入西居延海。额济纳河通过的唯一城镇是额济纳旗政府所在地达来呼布镇。