甘其毛都口岸位于巴彦淖尔市乌拉特中旗巴彦杭盖苏木境内，在中蒙边境线703号界标近处。口岸建设区总面积55.82公顷，与蒙古国南戈壁省汉博格德县嘎顺苏海图口岸相对应，距旗所在地海流图镇130公里。口岸附近地势开阔，砂石国防公路直通口岸，与主要公路干线相连接。

巴彦淖尔市乌拉特中旗与蒙方南戈壁省都是以畜牧业为主的经济类型区，巴彦淖尔市除北部畜牧业外，南部农业也较为发达。蒙古国南戈壁省有丰富的矿产资源，双方开展边境贸易和经济技术合作，具有一定的互补性。1989年8—9月，中蒙双方互派代表团访问，恢复了中断多年的边境贸易，签订了价值145万瑞士法郎的易货贸易合同。1989年12月20日，自治区人民政府批准甘其毛都为对蒙边境贸易临时过货点，1990年2月23日实现了首次过货。1992年6月24日，甘其毛都口岸正式被辟为国家一类季节性双边口岸。2004—2006年，经报请国家海关总署批准，甘其毛都口岸在非开放期间临时开放，进行煤炭运输。2004年7月5日，中蒙双方政府签署了《中华人民共和国政府和蒙古国政府关于中蒙边境口岸及其管理制度的协定》，9月28日该协定正式生效，甘其毛都口岸由双边季节性开放提升为双边性常年开放口岸。