红花尔基樟子松林国家级自然保护区于1998年建立，2003年晋升为国家级自然保护区。位于大兴安岭南段西坡，呼伦贝尔市鄂温克族自治旗的南端，坐落在红花尔基林业局红花尔基林场施业区内。西临呼伦贝尔草原，东枕大兴安岭西麓。保护区是沙地樟子松森林生态类型。

红花尔基樟子松林国家级自然保护区及周边地区野生动物多样性很高，而且珍稀种类丰富。保护区内的主要保护树种樟子松，其主要特征是生长在属于大陆性干旱气候的沙地上，具有耐严寒、耐干旱、耐瘠薄、耐严寒、抗风能力强的显著特点。它完全不同于分布在大兴安岭北部呼玛、漠河区域的与兴安落叶松混交的山地樟子松林，尤其是该物种种群历经历史沧桑，集中表现为樟子松林纯林，因世代分明，林型为纯林复层林，属沙地樟子松。由此可见，该保护区具有一定的典型性。

保护区从其保护对象在自然界中数量状况来看，具有一定的稀有性，是典型的稀有种群。保护区及周边区域的樟子松林又是在沙地中自然演替发展起来的，从一定意义上讲是稀有的生长环境。在内蒙古境内的毛乌素沙地、浑善达克沙地、科尔沁沙地、呼伦贝尔沙地中，只有呼伦贝尔沙地上形成了这样一个完整的沙地樟子松森林生态系统。因此，该保护区是稀有物种生存的关键性区域。

保护区内还栖息着许多珍稀濒危动物，如国家一类保护动物貂熊、金雕、细嘴松鸡等。这些动物有较高的保护价值，在保护区内都有所分布。

保护区地处森林草原过渡地带。其保护区及周边区域土壤类型、动植物种类组成都含盖着森林区系的成分和草原区系的成分。因此，具有较强的生态系统多样性。