1946年，组建内蒙古自治运动联合会苏尼特右旗支会，隶属内蒙古自治运动联合会锡林郭勒盟分会和锡林郭勒盟民主政府领导，苏尼特右旗辖18个苏木。1947年5月，随锡林郭勒盟划归内蒙古自治政府领导。1948年8月，苏尼特右旗在阿拉腾高勒成立临时政府，辖18个苏木，其中4个苏木为解放区。1949年7月1日，苏尼特右旗人民政府正式成立，原有18个苏木改建为9个联合苏木，在新民乡租银地建立村。

1950年，将原有9个苏木改为7个牧业苏木和1个乡级农区（新民乡）。1956年1月25日，将察哈尔右翼后旗的新民区等地区划归苏尼特右旗人民政府管辖。1958年6月3日，经自治区人民委员会批准，旗人民委员会由温都尔庙迁往新建的赛汗塔拉镇。同年，将8个苏木（区）合并为5个人民公社。

1969年11月，苏尼特右旗划归乌兰察布盟领导，全旗辖11个牧业公社、1个农业公社、4个牧场、1个镇、1个办事处（朱日和办事处）；1980年5月，划回锡林郭勒盟。1981年初，全旗行政区域划分为1个镇、15个人民公社、1个朱日和地区。1983年，旗人大常委会和人民政府在全旗改革农村牧区“政社合一”体制，在原人民公社、镇的区域基础上，分别建立苏木、乡、镇人民代表大会和人民政府。1985年10月，朱日和地区办事处改为朱日和镇。

1999年，苏尼特右旗辖15个苏木（乡）、2个镇、70个嘎查（村民委员会）。

2001年，辖10个苏木、4个镇、55个嘎查、18个居民委员会、5个村民委员会。

2003年，辖9个苏木、4个镇、51个嘎查、18个居民委员会、5个村民委员会。

2006年，辖3个苏木、3个镇、51个嘎查、19个居民委员会、5个村民委员会。

2011年，辖3个苏木、3个镇、52个嘎查、13个社区居委会、5个村民委员会。

2012年，辖4个苏木、3个镇、58个嘎查、14个社区居委会、5个村民委员会。

截至2021年，苏尼特右旗辖4个苏木、3个镇、58个嘎查、14个社区居委会、5个村民委员会。