今苏尼特右旗地区，秦代属上谷代郡北境，西汉为匈奴单于庭统辖区，东汉为鲜卑辖地，三国、西晋属鲜卑拓跋氏政权统治区。东晋十六国时，先后为代、前秦、魏统辖区。北魏太和二十一年（497），今旗境属柔玄镇镇戍地区；东魏武定四年（546），今旗境基本属柔然辖区；北齐和北周时，为突厥统辖区。隋大业八年（612），今旗境赛汗塔拉以南、东南地区分属河东定襄郡、马邑郡；赛汗塔拉以北、东北部属突厥牙帐统辖地区。唐总章二年（669），今旗境属单于都护府所辖桑乾都督府管辖区；唐开元二十九年（741），今旗境属突厥牙帐统辖区；唐元和十五年（820），今旗境属振武节度使统治区。五代十国时期，归属契丹上京临潢府黑车子室韦辖地。辽代，为上京道所辖。金代，为弘吉剌部居。

元至顺元年（1330）时，今旗境属中书省上都路。明朝，今旗境为蒙古游牧地。清崇德七年（1642），苏尼特右旗设札萨克，辖境包括相当今旗境和二连浩特市地区，隶属锡林郭勒盟。

民国初年，沿袭清制。民国3年（1914），苏尼特右旗随锡林郭勒盟划归新设察哈尔特别区。民国17年（1928），今旗境改隶察哈尔省锡林郭勒盟。民国25年（1936），今旗境属伪蒙古军政府控制。民国26年（1937）“七七”事变后，察哈尔省沦陷，苏尼特右旗随锡林郭勒盟归伪蒙古联盟自治政府统辖；民国28年（1939），改隶伪蒙疆联合自治政府。民国34年（1945）日本投降后，今旗境复归察哈尔省锡林郭勒盟管辖。