民国元年（1912），扎鲁特左、右两翼旗隶属热河都统管辖的昭乌达盟。民国3年（1914），扎鲁特左、右两翼旗归属热河特别区都统。民国12年（1923），建鲁北镇。民国13年（1924），置鲁北设治局，隶属热河特别区。民国18年（1929）1月，扎鲁特旗归热河省政府管辖。

民国21年（1932）8月，将鲁北设治局改为鲁北县。民国22年（1933年），设置兴安西分省（省会开鲁），扎鲁特左、右两翼旗归属伪满洲国兴安西分省管辖，废除鲁北县置。民国23年（1934）11月，兴安西分省改为兴安西省。民国24年（1935）5月，伪满洲国将扎鲁特左、右两翼旗合并组建扎鲁特旗，伪旗公署驻鲁北街。同时，撤销鲁北县，扎鲁特旗隶属兴安西省。民国32年（1943）10月，扎鲁特旗隶属伪兴安总省所属兴安西地区行署。

1945年11月，扎鲁特旗成立临时政府。1946年1月，东蒙古自治政府成立。3月，扎鲁特旗建立自治政府，隶属于昭乌达省政府。1946年，撤销东蒙古自治政府，中共昭乌达省改称昭乌达盟行政委员会，隶属热河省，并把扎鲁特旗自治政府改为扎鲁特旗民主政府。8月，中共昭乌达盟委组成扎鲁特旗工作委员会，到扎鲁特旗开辟工作。