1945年，建立科尔沁左翼后旗地方自治政府，隶属科尔沁左翼前、中、后三旗联合办事处。1946年3月，科尔沁左翼后旗归属东蒙古人民自治政府兴安南地区行署。4月，撤销兴安南地区行署后，科尔沁左翼后旗改隶哲里木省（今通辽市）政府。5月，科尔沁左翼后旗随哲里木省政府归属辽西区行政公署。6月，哲里木省政府改为哲里木盟政府，并隶属辽吉区行政公署，科尔沁左翼后旗为哲里木盟政府的隶属旗。1948年8月，哲里木盟政府归属辽北省，科尔沁左翼后旗一同归属。1949年4月21日，科尔沁左翼后旗随哲里木盟划归内蒙古自治政府管辖。

1953年3月，撤销哲里木盟，科尔沁左翼后旗人民政府隶属中共内蒙古自治区委党史和地方志研究室网站东部区行政公署。1954年4月，撤销中共内蒙古自治区委党史和地方志研究室网站东部区行政公署，恢复哲里木盟，科尔沁左翼后旗亦为中共内蒙古自治区委党史和地方志研究室网站哲里木盟直属旗。1955年，旗人民委员会由吉尔嘎朗镇迁驻甘旗卡镇。1958年“撤乡建社”，成立19个人民公社。