民国元年（1912）5月，归化城厅改为归化县，仍与土默特旗分治。归化县知事与土默特旗公署分驻于归化城。民国2年（1913），今土默特左旗区域基本属归绥县管辖。民国3年（1914）12月15日，设土默特旗总管，专理蒙民事务。民国4年（1915）1月，土默特旗总管公署成立，隶属绥远特别区都统管辖。

民国17年（1928）9月17日，国民政府下令，绥远特别区改建为绥远省，划归绥县城区为归绥市后，今土默特左旗区域属归绥县管辖。民国18年（1929）1月，绥远省政府正式成立后，归绥县知事改为县长（驻归绥市县府街），隶属绥远省政府管辖。民国22年（1933）2月，中共归绥中心县委在归绥市九龙湾街成立。

民国23年（1934），土默特旗总管公署改为土默特别旗政府，管理蒙民事务。民国25年（1936），土默特旗属绥远省境各盟旗地方自治政务委员会管辖。