金大定二十九年（1189）时，仍置有云内州（治所在今土默特左旗东南），辖云川县（治所在今土默特左旗东南）。元至元二十五年（1288），沿置云内州（治所在今土默特左旗东南），主要辖有今土默特左、右旗，隶属中书省大同路。

明洪武四年（1371），沿置云内州（治所今土默特左旗东南）。明洪武六年（1373），因兵民内迁州废。明宣德元年（1426），改置云内县（治所今土默特左旗境），隶属丰州。明嘉靖年间，蒙古族俺答部游牧于今土默特左旗境，为归化城土默特辖地。据考古发现，在铁帽乡苏卜盖村有两座古城，一在村内为大城，一在村东南1公里。从城内发现的遗物推断，两城应为16世纪明代蒙古阿拉坦汗率土默特部驻牧丰州滩后所筑“板升”城。