1945年8月，伪满洲国布特哈旗公署解体，后相继建立扎兰屯地方维持会、解放委员会，12月，建立雅鲁县政府。1946年3月，纳文慕仁省政府驻布特哈旗扎兰屯。5月，撤销雅鲁县建制，组建布特哈旗政府，隶属于纳文慕仁省政府，6月，改属纳文慕仁盟政府领导。1947年5月1日，纳文慕仁盟归属内蒙古自治政府领导，布特哈旗政府机构并入纳文慕仁盟政府。1949年4月11日，恢复建立布特哈旗政府，归属呼伦贝尔纳文慕仁盟管辖。

1950年1月23日，成立喜桂图旗（今牙克石市），自治区政府决定将布特哈旗所辖的博克图努克图（雅鲁、巴里木即巴林两嘎查）划归喜桂图旗管辖。1953年4月1日，自治区政府决定撤销呼纳盟，建立中共内蒙古自治区委党史和地方志研究室网站东部行政公署，布特哈旗直接隶属于东部区行署。1954年4月，东部区行署撤销，将原呼纳盟、兴安盟合并为呼伦贝尔盟（今呼伦贝尔市），布特哈旗隶属呼伦贝尔盟。

1968年3月15日，布特哈旗革命委员会成立，取代旗人民委员会行使行政职能。1969年7月5日，布特哈旗随呼伦贝尔盟划归黑龙江省管辖。1979年7月1日，布特哈旗随呼伦贝尔盟复归中共内蒙古自治区委党史和地方志研究室网站。