锡尼镇原名“贝勒音召”（后改称百灵庙），1950年，杭锦旗人民政府成立并将百灵庙作为旗府所在地，1956年设镇，名百灵镇，1957年改称“锡尼镇”。1958年，旗政府锡尼镇改为“人民公社”，1980年恢复镇建制。锡尼镇地处北纬39°22′3″～109°16′02″，东经106°55′16″～109°16′02″之间，位于杭锦旗境东南部，地势南高北低，平均海拔高度1389.5米。东与塔然高勒管委会毗邻，南与伊金霍洛旗、乌审旗接壤，西与鄂托克旗相连，北靠伊和乌素苏木。锡尼镇交通便利，南经过阿四线（阿勒腾席热镇—四十里梁）、阿锡线（阿勒腾席热镇—锡尼镇）、胜科线（锡尼镇胜利村—乌审旗科研化工厂），直通伊金霍洛旗、乌审旗；北有锡乌线（锡尼镇—乌拉特前旗）、锡磴线（锡尼镇—磴口县），可达巴彦淖尔市磴口县、乌拉特前旗、临河区及包头市。109国道及荣乌高速公路横穿东西，215省道贯通南北，镇区距东胜区118千米。

辖区总面积3109平方千米，有机关单位62个，事业单位122个，中介机构6个，民间组织社会团体9个，是杭锦旗政治、经济、文化中心。总人口5.7万人，农牧业常住人口1.8万人，城镇人口3.9万人，其中少数民族人口0.5万人，下辖21个嘎查村和6个社区。

2002年，锡尼镇获得自治区丙级“四星级文明城镇”称号。2004年，锡尼镇被建设部等六部委确定为全国重点镇。