1949年2月8日，经中共三边地委批准，鄂托克旗自治政府筹备处成立。9月7日，鄂托克旗政务委员会成立。12月21日，绥远省军政委员会决定，撤销桃力民办事处，将桃力民地区的大部划归鄂托克旗。

1950年5月，鄂托克旗人民政府成立。同时，将全旗行政区域划分为15个区、43个乡。1954年3月，随伊克昭盟（今鄂尔多斯市）归属内蒙古自治区人民政府领导。

1956年2月15日，划旗境西部桌子山为伊克昭盟人民委员会直属矿区办事处。同年，鄂托克旗人民委员会将9个牧业区改划为13个苏木，将6个农业区合并为3个中心区，下辖15个乡。1958年，将旗辖苏木、区、乡统一调整改建为16个人民公社，并增置桌子山矿区（后归属乌海市）。