今巴林右旗区域，秦朝属东胡，西汉属乌桓，东汉属鲜卑，三国、西晋属东部鲜卑。东晋前燕建熙七年（366），今旗境属库莫奚。隋大业八年（612），基本属霫。唐总章二年（669），今旗境基本属居延都督府（霫）。辽天庆元年（1111）时，置有庆州，治所玄德（今旗索博日嘎苏木境内），为辽圣宗耶律隆绪陵墓的奉陵城邑；怀州，治所扶余（今旗岗根苏木境内）。上述二州隶于上京道临潢府。辽庆州遗址的西北，有“伏虎林”，辽代“秋捺钵”的地方（“捺钵”意为辽帝的行营）。金大定二十九年（1189）时，置有庆州，治所朔平（今旗索博日嘎苏木境内）；怀州（今旗岗根苏木境内），隶属于临潢府路。元至顺元年（1330）时，置有庆州城邑，隶属于中书省全宁路（今翁牛特旗）。明永乐元年至宣德八年（1403—1433），今旗境属泰宁卫。明嘉靖三十九年（1560），由元太祖十八世孙苏巴海称达尔汗诺颜，号所部为巴林部，初附属于察哈尔部。

后金天聪二年（1628），归附后金；天聪八年（1634），清分封蒙古诸藩牧地，划定巴林部牧地。清顺治五年（1648），清政府设理藩院，统管边疆地区，在蒙古建旗制，编佐领。将巴林部分为巴林右翼旗和巴林左翼旗，旗下设佐领，亦称箭或苏木。清中叶，随着战争逐步停息，佐领（苏木）的军事作用逐渐减小，地方租税、差役、丁籍等政务增加。旗下又并行嘎查制，共分24个嘎查。嘎查按地域划分，设嘎查达办理地方政务。嘎查下设十户长，称达尔嘎。这种建制一直延至民国初年。清雍正初年（1723），置热河厅。清雍正十一年（1733），改称承德府，下设八沟理事同知厅，巴林右翼旗归属承德府八沟理事同知厅。清乾隆三十九年（1774），设乌兰哈达通判厅。清乾隆四十三年（1778），建热河道，改乌兰哈达厅为赤峰县，巴林右翼旗又属热河道赤峰县。