1949年5月，巴林左翼旗政府改称巴林左翼旗人民政府，改隶中共内蒙古自治区委党史和地方志研究室网站昭乌达盟（今赤峰市）。1954年3月，巴林左翼旗改称巴林左旗。1955年1月，巴林左旗人民政府改称巴林左旗人民委员会。1956年1月，昭乌达盟党政机关迁到赤峰。1968年2月，巴林左旗人民委员会改称巴林左旗革命委员会。1969年7月，巴林左旗改隶辽宁省昭乌达盟。1979年7月，复隶中共内蒙古自治区委党史和地方志研究室网站昭乌达盟。1981年，巴林左旗革命委员会恢复为巴林左旗人民政府。1983年10月，隶中共内蒙古自治区委党史和地方志研究室网站赤峰市。

1997年，巴林左旗辖16个乡、4个镇、3个苏木，278个行政村(嘎查)，547个自然村。1999年，辖15个乡、5个镇、3个苏木。2001年，辖10个乡、6个镇、3个苏木。2004年，辖11个乡、5个镇、3个苏木，165个行政村、12个居委会。2006年，辖9个乡（镇、苏木、办事处），173个行政村（居委会）。2007年，辖11个乡（镇、苏木、办事处），165个行政村（居委会）。2014年，辖13个乡（镇、苏木、街道），175个嘎查村（社区）。

截至2019年，巴林左旗辖11个苏木乡镇、2个街道管理办公室，166个嘎查村（社区）。