元朝至顺元年（1330），置兀剌海路，治所兀剌海城（此时兀剌海城约在今海流图镇附近），隶属甘肃行省。明朝初，今乌拉特中旗境阴山以南属山西布政使东胜卫管辖地，阴山以北属蒙古统辖，以后全境为蒙古牧地。明崇祯六年、清天聪七年（1633），乌拉特部驻牧地。清顺治五年（1648），编乌拉特部为乌拉特前旗、中旗、后旗（亦称西公、中公、东公旗）。今乌拉特中旗区域（包括原乌拉特中旗中东部和乌拉特后旗地区）。清王朝册封图巴为乌拉特中旗镇国公爵位，并授札萨克职，世袭掌理旗务；册封巴克巴海为乌拉特后旗辅国公，授札萨克职，世袭掌管乌拉特后旗旗务。两旗属乌兰察布盟（今乌兰察布市）。