明朝初，今临河区境属宁夏卫，隶属陕西统领；明正德五年（1510）后，统属蒙古鄂尔多斯万户；明万历十年（1582）时，今区境属河套“袄儿都司”辖地。

清顺治六年（1649），编鄂尔多斯右翼后旗（即杭锦旗），今临河区境大部属鄂尔多斯右翼后旗辖地，隶属伊克昭盟（今鄂尔多斯市）；清乾隆四年（1739），改隶山西萨拉齐协理通判厅遥领；清乾隆六年（1741），为归绥道所属萨拉齐协理通判厅领辖（清政府在强家油房设垦务局）；清光绪二十九年（1903），今临河区境属新建的归绥道五原厅（治所兴盛旺，后移至隆兴长）管辖。