民国28年（1939），建立中国共产党萨拉齐县地下工作委员会。翌年，成立萨拉齐县抗日民主政府（属大青山抗日游击根据地）。

民国34年（1945）8月22日，萨拉齐县和土默特旗分别恢复县政府和总管公署，隶属绥远省政府。萨拉齐县隶属绥远省第一督察专员公署。

民国38年（1949），萨拉齐县和土默特旗均随绥远“9·19”和平起义而解放。同年12月，成立萨拉齐县武装人民委员会。

1950年3月1日，土默特旗人民委员会成立，旗人民委员会办公地在归绥县（今呼和浩特）议事厅巷原土默特别务衙署。

1950年3月21日，萨拉齐县人民委员会成立，人民委员会驻萨拉齐城内原县衙门。行政沿用旧制，仍实行蒙汉分治。同年，绥中地委驻萨拉齐，改称萨县专员公署。

1952年，撤销萨县专员公署，并入平地泉专员公署，后平地泉专员公署改称集宁专员公署，萨拉齐县、土默特旗均属之。同年6月，原属固阳县的耳沁尧、公山湾划入萨拉齐县。

1954年，绥蒙合并，撤销绥远省，并入中共内蒙古自治区委党史和地方志研究室网站。

1955年，将准格尔旗黄河北岸的1区、14区（今属将军尧镇）划归萨拉齐县。