民国年间仍实行蒙汉分治，旗县并存。民国元年（1912），五原厅改五原县。今青山区境汉民属之。民国12年（1923），包头镇改置为包头设治局。今青山区境汉人改由包头设治局管辖，蒙古族居民仍归乌拉特三公旗管辖。民国15年（1926）1月1日，包头设治局改置为包头县。今青山区境汉民属之。

民国26年（1937）10月17日，包头县被日本侵略军侵占，今青山区境也随之沦陷。民国27年（1938）11月，伪蒙古联盟自治政府将包头县改设为包头特别市（后又改为包头市）。今青山区境属之。

民国34年（1945）8月，日本侵略者投降，包头光复，又恢复包头县原名，但仍保留包头市建置。今青山区境属之。

民国37年（1948）10月24日至11月27日，中国人民解放军华北三兵团解放包头市，成立包头市军事管制委员会、中共包头市委、包头市人民政府、包头市卫戍司令部。今青山区境随之解放。11月28日，人民解放军及有关机构奉命撤离包头市。国民党政府又行复辟。

民国38年（1949）9月19日，今青山区境随着绥远省的和平解放而解放。