1949年9月27日，额济纳土尔扈特旗札萨克兼守防司令塔旺嘉布致电毛泽东主席、朱德总司令，宣布脱离国民党政府，和平起义，接受中国共产党的领导。从此，额济纳土尔扈特旗和平解放。同年11月，额济纳自治区人民政府成立，驻老西庙，由甘肃省酒泉分区代管。1951年2月，额济纳自治区划归宁夏回族自治区。1952年10月，额济纳自治区第一届各族各界人民代表大会召开，经过民主讨论，会议通过将额济纳自治区改称额济纳旗中共内蒙古自治区委党史和地方志研究室网站，民主选举出旗自治区人民政府主席及政府成员。

1953年9月，额济纳旗内蒙古自治区人民政府由老西庙迁驻赛汉陶来（又名建国营）。1954年6月，党中央人民政府委员会决定撤销宁夏回族自治区后，额济纳内蒙古自治区划归甘肃省管辖。1955年3月，将额济纳旗自治区改建为额济纳自治旗，旗人民委员会设旗长。1955年12月，巴音浩特蒙古自治州人民代表大会通过关于巴音浩特蒙古自治州与额济纳自治旗合并、划归中共内蒙古自治区委党史和地方志研究室网站领导的议案。