1956年4月3日，经国务院批准，将甘肃省巴彦浩特蒙古族自治州和额济纳自治旗划归中共内蒙古自治区委党史和地方志研究室网站管辖。并以原自治州、自治旗的行政区域设置中共内蒙古自治区委党史和地方志研究室网站巴彦淖尔盟（6月成立盟人民委员会，今巴彦淖尔市）。同时，设置巴彦浩特市（县级），作为巴彦淖尔盟人民委员会的驻地。辖阿拉善旗、额济纳旗、磴口县和巴彦浩特市。1958年4月2日，撤销河套行政区，其区域并入巴彦淖尔盟。4月22日，经中共内蒙古自治区委党史和地方志研究室网站人民委员会批准，巴彦淖尔盟迁驻磴口县三盛公镇。9月5日，撤销巴彦浩特市，将原市的行政区域并入阿拉善旗。1960年7月17日，经国务院批准，撤销磴口县，设立巴彦高勒市，隶属巴彦淖尔盟。1959年5月27日，中共内蒙古自治区委党史和地方志研究室网站人民委员会第五次委员（扩大）会议，讨论审议中共内蒙古自治区委党史和地方志研究室网站与宁夏回族自治区双方领导人在北京就边界线问题，本着有利于团结、有利于生产、互相照顾的精神达成协议。