明初，阿拉善、额济纳为甘州、肃州边外地。明正德五年（1510），阿拉善为蒙古鄂尔多斯辖地。后来蒙古霍硕特部（有记载为“和硕特”）游牧套西。清康熙二十五年（1686），和罗理率部归清，清朝赐贺兰山以西区域为其牧地。自此，和罗理霍硕特部始定阿拉善。清康熙三十六年（1697），清朝编设阿拉善霍硕特旗（辖境包括今阿拉善左旗、阿拉善右旗大部、乌海市部分和磴口县等区域），赐印授札萨克，封和罗理为多罗贝勒，掌理旗务。旗衙门设在紫泥湖（今阿拉善左旗锡林高勒苏木驻地）。清康熙四十三年（1704），额鲁特土尔扈特部首领阿拉布珠尔在北京觐见康熙皇帝，被封爵为固山贝子，并赐嘉峪关外党河、马海和色尔腾湖为其牧地。清雍正元年（1723），清朝在贺兰山以西建定远城（今巴彦浩特镇）。翌年，命因战功被晋升多罗郡王的阿宝镇守定远城（旗衙门由紫泥湖迁驻定远城）。清雍正九年（1731），土尔扈特部内徙额济纳河流域。清乾隆十八年（1753），编设额济纳土尔扈特旗（辖境包括今额济纳旗和阿拉善右旗南部部分区域），置札萨克掌理旗务。阿拉善霍硕特旗、额济纳土尔扈特旗均不设盟，直属清理藩院。这里有“西套蒙古”之称。