民国35年（1946）农历正月，杨宝山托病回延安汇报工作，李富春鼓励他继续隐蔽。2月，又回到西官府。翌年，党中央撤离延安，他失去与上级的直接联系，但始终未暴露自己的身份。在等待党中央机要局的指示期间，有时也与当地中共组织保持某些联系，并协助做一些特定的工作，直到鄂托克旗解放为止。

1949年8月，鄂托克旗中华人民共和国成立后，他担任鄂托克旗临时人民政府三科科长、公安局长、人民政府委员、副旗长、旗委副书记等职。曾于1952年到北京参加国庆观礼，多次受到党中央领导人的宴请。1954年7月至1957年，离职到内蒙古干部文化学校学习。1960年7月，调任伊克昭盟（今鄂尔多斯市）盟委统战部副部长兼盟政治学校校长。1965年初，任统战部副部长兼盟宗教处处长。

中共十一届三中全会后，杨宝山历任伊克昭盟第三、四、五届政协常委。1980年11月，被选为第六届政协副主席。1994年3月12日，在伊克昭盟医院逝世，享年79岁。