1949年2月，在准格尔旗达成“沙圪堵协议”，促成8月5日郡王旗的和平解放。中华人民共和国成立初，云北峰任中共伊克昭盟（今鄂尔多斯市）委员会委员、中共郡王旗旗委第一任书记。1951年，参加绥远省河套地区土改工作团，负责协助河套地委解决土地改革工作中的民族关系问题。1952年，任中共河套地委副书记、河套公署专员。1955年，任中共乌兰察布盟（今乌兰察布市）盟委书记、盟长、乌兰察布军分区政委。1957年，任内蒙古城建局局长、党组书记。1962年，先后任内蒙古农牧林委员会副主任、主任、党组书记，内蒙古党委代常委。

1978年，云北峰调任中国社会科学院民族研究所所长、党委书记。1979年，任全国人民代表大会民族委员会秘书长、党组副书记，同时兼任全国人大常委会委员会机关党组成员、党中央起草民族区域自治法领导小组成员。1986年8月12日，因病在北京逝世，享年70岁。