清真寺亦称礼拜寺，阿拉伯语音译意为麦斯吉德，意为礼拜的场所，含有聚会的社交场所之意，是信奉伊斯兰教各族穆斯林进行宗教活动传授宗教知识的场所，也是广大穆斯林群众社会活动、节日聚会的地方。

呼伦贝尔盟（今呼伦贝尔市）历史最早的清真寺是1912年兴建的海拉尔清真寺和俄国鞑靼人建立的满洲里鞑靼伊斯兰教堂，其次为扎兰屯清真寺（1921）、海拉尔俄国人建立的伊斯兰教堂（1925）和牙克石清真寺（1935）。

1949年前，呼伦贝尔盟有清真寺3座，鞑靼伊斯兰教堂2座。

呼伦贝尔盟清真寺大都由回族群众集资兴建，均为平房建筑，一般是土木或砖瓦结构。较大的清真寺有伊斯兰教明显标志的望月楼，以海市1926年重建的清真寺为代表，是当时全盟最大的清真寺。另两座俄侨建的鞑靼伊斯兰教堂为木结构、铁皮盖，俄式建筑风格。

1949年后，呼伦贝尔盟回族穆斯林人口不断增长。1951年额尔古纳右旗（简称额右旗）三河清真寺、1954年扎赉诺尔清真寺陆续兴建。1955年，额右旗由山东迁来419户回族群众，又先后在三河、上护林、下护林、建设屯、团结屯兴建改建5座清真寺。

20世纪60年代，随着大兴安岭林区的开发，额尔古纳左旗（简称额左旗）根河镇、图里河镇、伊图里河镇和莫旗尼尔基镇等先后兴建清真寺或沐浴室。

至1966年“文化大革命”前，全盟有清真寺17座。“文化大革命”中，全盟的清真寺均被关闭、毁坏或作他用，宗教活动被迫停止达10余年。

1978年以后，经拨乱反正，各级政府拨款修缮并重新开放原有的清真寺，又在回族聚居的大杨树、阿里河、甘河、免渡河、新右旗、乌尔旗汉、拉布大林、大雁、巴彦库仁、巴彦托海等地先后修建或改建清真寺十几座。

清真寺的修建资金一般由回族群众集资、政府拨款、民族事务部门资助，或一些企事业单位捐助而建。

至1989年，全盟共有清真寺28座，除阿荣旗、新巴尔虎左旗外，各旗市均有清真寺。其中满洲里市2座（扎区1座）、海拉尔市1座、牙克石市有5座、额右旗8座、鄂温克族自治旗2座、鄂伦春自治旗3座、额左旗3座、扎兰屯市、莫力达瓦达斡尔族自治旗、新巴尔虎右旗、陈巴尔虎旗各1座。