呼日查干淖尔水系，为阴山以北的内陆水系，位于锡林郭勒盟阿巴嘎旗南部，正蓝旗北部，主要河流有高格斯台河、恩格尔河，两河均注入阿巴嘎旗南部的呼日查干淖尔，总流域面积7880平方公里。

高格斯台河

高格斯台河，亦称巴音河、昌都河，发源于正蓝旗北端沙地，赛音呼都嘎苏木园里子山东南山处。海拔高程1448米，北纬42°42′，东经116°33′，向西北流至阿尔善塔拉，与发源于正蓝旗北端伊和陶来图的辉腾河汇合，继续向西北流至阿巴嘎旗的格和尔注入呼日查干淖尔。入口高程为1018米。该河上游称那仁塔拉郭勒（河），乌尔图塔拉郭勒，中游一段称加其尔音郭勒，下游一段称昌都音郭勒。全河在崩肯以上河床不明显，两岸均为沙丘地带，并有准洪特等淖尔汇入（咸水淖）调节水量。崩肯以下均有清水，左侧多为沙丘地带，无明显支流，在下游有珠尔戈代郭勒穿过呼舒淖尔，在郭勒德尔斯汇入。右侧大部为丘陵带，在中游有沙尔音郭勒、辉腾郭勒、好来音郭勒汇入。河道比降为1/400～1/900，河宽为3～10米，河长223.7公里，积水面积5145.4平方公里，河水矿化度每升大于1克，水化学类型为氯化物型，因受沙地调蓄的影响，河水流量由上游至下游是逐渐增加，具有年内变化不大和洪水涨落平稳的特点。

恩格尔河

恩格尔河，亦称努格斯台河，发源于正蓝旗扎格斯台苏木塔日彦格塔拉西北。海拔高程为1300米，北纬42°54′，东经115°38′，向西北经扎格斯台淖尔等，流至萨拉东南注入呼日查干淖尔。在哈尔干特以上河床不明显，以下均有清水。河两侧均为沙丘地带，上中游无明显支流汇入，下游有恩格尔郭勒从右侧汇入。河谷至恩格尔庙以上甚为狭小，且皆为沙丘所包围，自恩格尔庙以下，河谷宽为2～3公里，河道比降1/300～1/500，河宽2～5米，积水面积1239.46平方公里，因有地下水补给河流也具有洪枯水变化不大的特点。